Los parásitos internos se denominan endoparásitos. Entre los más comunes están: Ancylostomatideos, Toxocara sp, Coccideos, Giardia, Trichuris sp y Dipilidium sp. Dependiendo del tipo de parásito, la carga parasitaria, la condición del animal, entre otros, pueden llegar a causar enfermedades muy severas.

A los 15 días de nacido, todo cachorro (perro/gato) necesita su primera desparasitación, y esto debe repetirse cada dos semanas hasta que cumpla los dos meses de edad. Después de esto la desparasitación se realiza una vez al mes hasta los 4 meses de edad, luego cada dos meses hasta el año de edad y por último, cuando es adulto, cada 3 meses según criterio del
médico veterinario.
Siempre es importante el efectuar un examen coprológico antes de realizar la desparasitación para determinar cuál es el desparasitante más adecuado para su mascota.